代表性核心库(基于Bemis-Murcko Clustering算法)

Representative Compounds Library (Bemis-Murcko Clustering Algorithm)
产品编号: DD3700

300k代表性化合物库是基于生成Bemis-Murcko骨架,过滤和三类挑选构建而成。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
DD3700
产品编号: DD3700
规格
30 μL x 10 mM (in DMSO)
50 μL x 10 mM (in DMSO)
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)
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技术资料
产品描述
产品描述:

从ChemDiv 160万库存中基于Bemis-Murcko聚类工作流程筛选出的30万多样化选择:

  1. 为整个160万ChemDiv库存中的每个分子生成Bemis-Murcko骨架(BMS)
  2. 应用REOS、MedChem和PAINS过滤器去除反应性、毒性、混杂性及其他不良结构基团
  3. 然后应用物理化学性质过滤器去除非药物样分子
  4. 对于剩余的选择,为每个分子生成Bemis-Murcko骨架(BMS),计算唯一BMS的数量及每个BMS对应的分子数量
  5. 将选择分为三类以便未来聚类和多样性挑选:
    a. 每个唯一BMS对应的单个分子数量:1-3
    b. 每个唯一BMS对应的单个分子数量:4-1000
    c. 每个唯一BMS对应的单个分子数量:>1000
  6. 使用RDKit MaxMin算法(Tanimoto,ECFP4,2048位)在每个类别内对每个BMS的单个分子进行迭代选择(即聚类),聚类大小(即每个BMS挑选的单个分子数量)通过公式计算
  7. 将所有三类选择合并为最终的30万集合
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