基于片段的药物设计(Fragment-based drug design, FBDD)

FBDD的理论基础是挑选有利的片段组合或延伸得到新药物分子,获得高活性的候选药物

FBDD方法成功运用

蛋白相互作用等复杂靶点,其结合口袋较为平坦,化合物难以结合,HTS在这一领域几乎失效, FBDD则可先识别具有弱结合作用的小片段,进一步优化结构,获得潜在成药化合物。

目前通过这种方式已发现多个小分子药物,其中有30多个进入临床阶段,以及两个上市药物:Vemurafenib & Venetoclax。

鉴于FBDD方法的成功运用,其在药物研发领域将会更受药物研发专家青睐。

药筛网在片段化合物上的优势

一个好的片段库是FBDD方法成功的前提条件。对于片段库而言,一般需要考虑Ro3原则(mw<300,HBA<3,HBD<3,Rotable bond<3,

cLogP<3)、3D结构多样性、溶解性等。 此外,有些研究人员会对含特定基团的片段库感兴趣,比如含氟片段、含溴片段等。

结合实验特点,选择合适的片段库可以缩小筛选范围,更加合理的设计药物,为后续药物开发减小难度。 药筛网收集了46万余种片段化合物数据,为研究人员提供更多的选择。

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