三维空间结构和药效团生物活性多样性库
结构多样性极为重要，因为分子形状是介导分子生物效应的最关键因素之一。此外，增加三维形状可以由于更大的溶剂化和较差的固态晶格堆积而提高水溶性，并改善ADMET性质。因此，增加分子的三维形状与更广泛的生物活性相关。研究表明，分子形状更多地由核心化合物骨架决定，而不是由装饰核心骨架的取代基的形状或位置决定。因此，与单一骨架库相比，由多种三维骨架组成的库预计会显示出更广泛的生物活性。
该库展示了从三维聚类生物注释化学空间中最活跃的化合物。化合物的三维聚类是基于其形状和药效团特征进行的。针对每种测定，识别了针对不同靶标的最活跃化合物。潜在靶标包括酶、膜受体、转录因子、表观遗传调节因子、离子通道、转运蛋白及其他蛋白质。该库由蛋白质抑制剂/激活剂和受体激动剂/拮抗剂组成。这组生物活性化合物的特点是分子量较低，以利于吸收，具有最佳的LogP值和最佳的可溶性极性表面积（PSA）。
ChemDiv 3D生物多样性库包含34,000种化合物。
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陶术生物化合物库目录(60.2 MB) 
库化合物信息
Excel 
SDF 3D-Biodiversity化合物库挑选流程：
第一步：从160万个化合物中剔除148万，仅保留有活性注解或文献参考的12万个产品。
第二步：去除不稳定易反应的产品，降低Hit结构优化难度。
第三步：去除有毒产品，降低先导化合物药理、毒理研究中可能出现的不利风险，加速进入临床期。
第四步：选择活性效果好的产品，例如有效浓度小于10 μM的产品。每种结构历经不断的活性模拟，是您安心的选择。
第五步：过滤掉专一性差的产品，留下靶点特异性强的小分子化合物，提高筛选效率与成功率。
第六步：根据3D结构和药效官能团的特征，将剩余产品分组，去除结构或官能团相似的产品，保留30,000个，免费提供SDF数据文件，便于药理研究和计算机虚拟筛选。
3D-Biodiversity化合物库其他特色：化合物结构清晰、靶点信息明确、IC50值、活性描述全面，翔实。
