天然产物(NP)多年来被广泛用于治疗各种疾病。过去30年的分析显示,美国食品药品监督管理局(FDA)批准的药物中,约40%是天然产物、其衍生物或与天然产物相关的合成模拟物。凭借其高度复杂且多样化的生物和化学特性,天然产物及其衍生物被用于探索生物学相关领域。天然产物在治疗药物发现中的重大影响,源于其内嵌的生物合成分子识别机制。
三维多样性至关重要,因为分子形状是生物分子识别中最重要的因素之一。该库包含基于药效团三维相似性度量的1479个簇和738个独特的杂环化合物。库设计的关键概念包括三维形状、药效团多样性、药物相似性和化学美感。与二维库相比,三维库的优势在于更高的sp3含量和QED值。化合物筛选流程包括四个阶段,旨在从每个簇中选择最具多样性和活性的分子。
ChemDiv的3D多样性天然产物类似物库包含21,000种化合物。
由于天然产物及其衍生物具有高度复杂的生物和化学多样性,其已被用于探索生物相关领域。天然产物及其衍生物对于药物发现的重大影响是基于其嵌入的生物合成分子识别来发挥作用的。天然产物及其衍生物的三维结构多样性也是至关重要的,因为分子构型是生物分子识别分子的最重要因素之一。该库包含1479个基于药效团3D相似性度量的聚类和738个独特的杂环。该化合物库主要的设计理念是3D结构、药效团多样性和药物相似性。3D库相对于2D库的优势在于更高的sp3和QED值从每个簇中选择最多样化和最活跃的分子。