变构GPCR调节剂库包含14400个化合物。旨在发现新的异位调控配体。小分子对GPCR的异位调控可以促使受体发生构象变化,通常在无明显效应的情况下,但在正位内源性配体存在时,对信号传导途径可以产生强烈的影响。另一方面,由难以处理的刺激引发的GPCR可以通过异位调控进行调节,为这些目前无法攻克的靶点提供了新的机会。 https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/gpcr-library/allosteric-gpcr-library
在库的设计中,既使用了基于配体的方法,也使用了基于结构的方法。基于配体的方法依赖于使用具有高活性值的已知配体的参考集进行三维药效团搜索(来自ChEMBL和BindingDB的200多个化合物)。主要关注于已在药物发现中得到确认的B类GPCR的异位调节剂。使用参考化合物集创建了两个药效团模型,并使用活性和非活性配体的训练集进行验证。基于结构的方法应用于人类胰高血糖素受体(GCGR)和人类促肾上腺皮质激素释放因子1受体(CRF1R)。优化了5EE7和4K5Y PDB条目中记录的相应蛋白质结构,并使用Glide(Schrödinger软件)进行对接计算。与共结晶配体相比,至少具有50%的评分效力的化合物被选为命中物,并包括在目标集中:h-GCGR集合- 200个化合物;h-CRF1R集合- 7,200个化合物。