活性化学空间库

Annotated space Library
产品编号: DD5900

ChemDiv 推出了包含18,000种化合物的活性空间库。该库涵盖了近10多年内上市的900种药物所涉及的38个已验证靶点。

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DD5900
产品编号: DD5900
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技术资料
产品描述
产品描述:

化合物基于相应数据、CATS描述符以及药物分子和靶标的三维构象进行设计和筛选。训练了一个神经网络用于预测靶标活性和化合物筛选。

  • 训练集:
    1.收集过去10年中900种已上市或正在进行临床试验的药物(38个靶点)。
    2.对于每个结构,生成300个3D构象。
    3.为每个样品选择了100种具有多样性的构象。
    4.计算所有构象的CATS 3D描述符。
  • 靶点集:
    1.对ChemDiv库中超过150万种化合物应用了软性MCF和药物相似性筛选。
    2.使用Corina软件为每个分子生成了3D构象,共计256,000个。
    3.从初始构象中生成了100种构象,并从中筛选出约10种差异最大的构象(总计250万样本)。
    4.对所有构象计算了CATS 3D描述符。
  • 算法:
    1.训练了一个神经网络用于预测目标活性。模型独立地对每个目标进行活性预测(0或1)。
    2.通过迭代优化,为每个目标选择单独的二值化阈值以做出最终决策。
    3.在训练集10%的验证集上计算了数值指标。此外,还在独立样本中的10种化合物上评估了模型的质量。
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