抗炎症化合物库是通过2D指纹相似性搜索创建的。2D指纹相似性搜索是指将活性化合物的参考集（其活性数据在文献中报告）和感兴趣的分子表示为一组编码为位串（“指纹”）的小片段。将两组“指纹”进行比较，以估计它们的相似程度。首先，从ChEMBL数据库中获取了已知调节炎症靶点的参考分子集。然后，对Life Chemicals HTS化合物库进行2D指纹相似性搜索，使用Tanimoto指数≥ 0.8（每个参考化合物最多10个类似物），结果得到近1700种与炎症相关的筛选化合物。该库不包含PAINS、有毒和反应性化合物。

通过对接筛选的炎症靶向化合物库
这个筛选集是基于已发表的蛋白质相互作用信号通路和蛋白质结构数据可用性（RCSB蛋白质数据库）以及活性蛋白质抑制剂（ChEMBL数据库）设计的。使用对接筛选方法对Life Chemicals HTS化合物库进行筛选，共发现了超过1200种潜在的抗炎症剂。以下与炎症相关的分子靶点参与其他调节剂的激活或增强防御。