ATPase是一类酶,通过水解磷酸酯键将ATP转化为ADP。ATPase是四种不同类型的ATPase(P、V、F和ABC类型),它们在生物膜内起作用,目的是在这些膜上运输许多不同类型的离子或分子。这一过程释放的能量被用于催化其他细胞反应。因此,ATPase是参与能量稳态和信号转导的关键酶。
Life Chemicals设计了专有的ATP酶靶向库,其中包含超过13,500个类似药物的筛选化合物。该库是通过使用MDL通用参数(75-85%Tanimoto相似性截断)对两个不同的参考数据库进行2D指纹相似性搜索而设计的。
库设计
首先,使用相似性搜索(85%的Tanimoto相似性截断)将Life Chemicals HTS Compound Collection与30,000个具有报告的活性值低于11 uM的参考化合物进行了筛选,得到了一组超过5,000个结构多样的筛选化合物,具有潜在的ATPase抑制活性,适用于不同类型的靶向。然后,使用来自专利、科学出版物和其他来源的数据(根据PubChem和ChEMBL数据库)将HTS Compound Collection与包含13,000个生物活性化合物的ATPase相关测定的参考集进行了筛选,使用了75%的Tanimoto相似性。结果,另外选择了约8,500个潜在的ATPase抑制剂,使用了75%的Tanimoto相似性。所有结果都可以追溯到相应的SD文件中的“Target type”或“Description”栏中指示的靶向或测定。