阿尔茨海默病(AD)是最难治疗的中枢神经系统疾病之一。尽管在过去几十年里进行了大量的研究,但尚未开发出有效的药物来对抗这种可怕的疾病。然而,关于β-分泌酶抑制剂的最新数据在这个领域显示出了希望的结果。在疾病的早期阶段,BACE抑制似乎是对抗AD进展的强有力工具。这些数据为设计一个具有最多样化的化学类型和良好中枢神经系统特性的高质量BACE靶向库提供了基础。BACE库包含7171个化合物。 https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/bace-library
与BACE相关的活性数据库经过仔细整合(通过在ChEMBL和文献数据中进行搜索),共找到了7,465个报告了足够活性的化合物。同时,所有可用的PDB结构也进行了分析。选取了23个最具代表性的PDB复合物用于分子对接计算。
以下是进一步搜索BACE靶点潜在调节剂的算法:
步骤1:使用PDB、PDBe和pfam,选择所有可用的结构。同时根据文献数据和ChEMBL选择所有活性化合物。
步骤2:选择了23个最具代表性的结构进行分子对接(2b8v、2ohr、2viz、2wjo、2zdz、3exo、3fkt、3hw1、3in3、3l38、3l5b、3l5f、3rsx、3udy、3uqw、3vf3、4acu、4i10、4l7h、4xkx、5hdv、5kqf、5uyu)。
步骤3:然后使用获得的BACE受体结构和Enamine化学数据库进行灵活的分子对接。
步骤4:作为BACE蛋白靶点的结果,选择了7,171个化合物(对接库)。