近年来,应用表型筛选发现小分子药物的兴趣持续增加。而事实上过去大部分药物都是通过表型药物发现技术发现的。目前基于靶点和表型的药物发现方法仍然被广泛使用,它们各自具有优缺点,因此成功药物筛选的关键在于化合物库的设计。它应该涵盖广泛的分子过程和药物靶点,可以成为药物筛选项目的起点。构建用于表型筛选的化合物库的主要策略是从特定结构出发,选择化学多样性好化合物集合。而将已知化合物的生物学活性直接整合到筛选库的策略已将表型筛选提升到一个新的水平。作为市场上拥有大规模类药化合物库之一的公司,我们设计了两个精选的表型库,以促进基于细胞的表型药物发现筛选:ChemDiversity表型库(7,500个化合物)。生物活性多样性表型库(11,000 种化合物)
生物多样性表型库(总共近11,000种化合物)除了尽可能应用结构多样性规则外,还优先考虑化合物的多样化生物活性。它包括从 ChEMBL 和 DrugBank 数据库中提取的 4,100 多种具有实验生物活性的化合物(包括一些已批准的药物)。通过应用二维指纹相似性搜索(Tanimoto ≥ 3.500),还添加了3400 种与天然产物相关的化合物(包括约1500 种类似天然的片段)。
该库包含指向 ChEMBL 数据库中化合物生物活性的链接并提供各种化合物注释(例如与每种化合物相关的所有靶标的 UniProt ID)。
BioDiversity表型库(总计近11,000个化合物)除了尽可能应用结构差异规则外,还有一个不同的基本原则,即优先考虑化合物的最大生物多样性活性。它包括超过4,100个具有实验生物活性的化合物(包括一些已批准和实验性药物),这些化合物从ChEMBL和DrugBank数据库中提取而来。此外,通过应用2D指纹相似性搜索(Tanimoto ≥ 0.85),该库还增加了3,500个上述生物活性化合物的类似物。此外,还添加了3,400个与天然产物相关的化合物(包括约1,500个类似天然产物的片段),以填充库中更多的生物相关分子。该库不包含反应性、有毒和PAINS化合物,以及具有低水溶性(LogSw)和Caco/MDCK细胞渗透性(计算数据)的化合物。该库中包含了化合物在ChEMBL数据库中的生物活性概况的链接。还提供了各种化合物注释(例如与每个化合物相关联的所有靶点的UniProt ID)。