ChemBridge的片段化合物库提供了超过13,500个化合物，可以单独选择，使研究人员能够构建最适合其研究目标和方法的片段集合，包括大小和组成。ChemBridge还可以协助选择包括结构多样性的子集。这个小分子片段的集合提供了用于基于片段的筛选和药物发现的化合物，包括高通量X射线晶体学、NMR、SPR和高浓度生物活性测定方法。片段库中的化合物是根据常用的Astex Rule of Three准则以及其他物理化学性质和亚结构过滤器选择的。 高溶解度子集 对于需要DMSO中更高溶解度（100mM或更高）的片段的研究人员，ChemBridge可以提供大约5,000个具有更高DMSO溶解度的片段子集的文件。
氟化子集
该片段子集对基于NMR的片段筛选具有优势，因为19F-NMR谱具有广泛的化学位移范围，可以通过相邻原子的影响在片段的结合和非结合状态下进行修饰。选择标准基于整个片段库集合使用的相同准则。
溴化子集
一种含溴片段的子集，可以在X射线晶体学筛选中发挥作用。溴原子的存在提供了确定片段与靶蛋白结合位置的证据。选择标准基于整个片段库集合使用的相同准则，但MW上限增加到380，以允许溴原子的贡献。