大环化合物为低成药性靶点(如抗菌、抗病毒及蛋白-蛋白相互作用靶点)提供了全新解决方案。2024年发表于《抗病毒研究》期刊的一篇文章报道,科研人员从ChemBridge公司的大环化合物库中筛选出一种能抑制拉沙病毒聚合酶的活性分子。该研究团队对5万种类先导化合物和约1万种大环化合物进行高通量筛选,最终发现具有聚合酶抑制活性的目标分子。
从拓扑结构来看,相较于同等分子量的非环状分子,大环化合物既能跨越较大表面积,又能保持构象受限的特性。大环化作用可降低整体极性并增强膜渗透性。这些独特优势使大环化合物成为攻克难靶点药物发现项目的有力工具。传统上,大环化合物通常指含12个或更多重原子的碳环或(更常见的)杂环结构,因其合成难度大且化学多样性构建困难而备受挑战。针对这些合成难题,ChemBridge公司已成功构建包含2万余种现货供应合成大环化合物的数据库。
特性
ChemBridge已开发出一系列多样化的合成大环化合物库,旨在为工业界和学术界研究人员提供靶标筛选的理想工具。该公司化学家团队基于新型大环骨架,研发了针对大环化合物合成与功能化的系统性策略。首批发售约7,000个大环化合物后,ChemBridge持续通过创新设计扩充该库——将专有片段整合至大环结构中,使大环化合物库规模逐年增长。目前该库已收录超过20,000种合成大环化合物。
ChemBridge大环化合物库的通用特性包括:
• 分子量上限850,其中90%化合物分子量介于450-750之间
• 主环原子数范围12-26(以最短路径/最少键数定义主环),90%化合物主环原子数为14-21
• 含杂原子主环结构
• 骨架包含或不包含肽链主环元素的大环结构
• 骨架包含或不包含稠环结构的主环大环化合物