基于文献数据，我们选择了最重要的功能基团，这些功能基团通过与半胱氨酸氨基酸残基形成共价键来靶向蛋白质的结合口袋。迈克尔受体是典型的功能基团，常常在这类共价抑制剂以及片段的结构中引入，能够进行亲核取代或加成反应。我们从Life Chemicals高通量筛选化合物库中选择了以Cys残基为焦点的共价抑制剂，采用以下共价弹头：
α,β-不饱和酮
α-氯乙酰胺
活化炔烃
丙烯腈
丙烯酰胺
环氧化物
甲基乙烯磺酮
苯磺酸酯
氨甲基丙烯酸甲酯
一级卤代烷
这些化合物通过以下"五原则"的预过滤限制：
分子量：150 - 500
ClogP（分配系数）：-1 - 5
氢供体：0 - 5
氢受体：0 - 10
可旋转键：≤ 10

该Cys焦点筛选化合物库提供了一系列多样化的化合物，具有与半胱氨酸残基选择性相互作用的潜力，并可用于开发新型共价抑制剂的药物研究。