半胱氨酸蛋白酶是生物学上最重要的一类蛋白质,参与多种细胞途径。它们在免疫入侵、寄生虫入侵、寄生虫逸出、水解、细胞外基质更新等多个过程中发挥作用,这使得它们成为多种疾病(如艾滋病、癌症、心血管和炎症性疾病、血栓形成、呼吸系统疾病、胰腺炎和神经系统疾病)的潜在药物靶点。
它们被分为14个超家族,在结构上有所不同,但共享一个共同的作用机制。半胱氨酸蛋白酶在蛋白质降解中的独特作用决定了其广泛的分布。这也意味着由于目标折叠特异性,活性位点具有可变性。半胱氨酸蛋白酶通常被含有亲电弹头的化合物(如环氧化物或乙烯基砜)靶向,这些化合物与活性中心的催化残基特异性相互作用,以模拟目标酶的肽底物。
半胱氨酸蛋白酶专有库包含超过9,200个筛选化合物,具有潜在的对半胱氨酸蛋白酶的抑制活性。
这个筛选库的设计采用了相似性搜索作为通用方法,用于寻找潜在的半胱氨酸蛋白酶抑制剂。首先,收集了一个包含超过15,000个生物活性化合物的参考数据库,这些化合物与半胱氨酸蛋白酶相关的检测数据来自专利和文献。然后,使用MDL公共键和大于85%的Tanimoto相似性,从Life Chemicals的HTS化合物库中搜索与参考数据库中的化合物相似的化合物。在这个库的制备过程中,没有应用PAINS过滤器,因为这些过滤器会由于半胱氨酸蛋白酶靶向药物的特性而去除相当一部分参考分子和类似的筛选化合物。反应性化合物则通过内部的药物化学(MedChem)过滤器去除。根据您的需求,可以定制化合物的选择,还提供了基于这个筛选库的预分装库。