DNA库是一个包含5760个化合物的库,旨在研究和探索与DNA相关的生物学过程和治疗策略。DNA是细胞中负责存储遗传信息的核酸分子,对于细胞周期和基因组稳定性的维持至关重要。 DNA库的设计目标是提供一系列具有潜在DNA相关活性的化合物,用于研究DNA复制、DNA修复和其他与DNA相关的生物过程。这些化合物可能具有特定的作用机制,如DNA结合、DNA酶活性、DNA修复途径的干预等,以帮助科学家深入了解DNA的功能和调控。 DNA库中的化合物可能是经过精心挑选和优化的,以确保其具有适当的类药性和生物活性。设计DNA库的过程可能涉及计算方法,如分子对接、虚拟筛选和药效团建模,以从大规模化合物库中选择具有潜在DNA活性的化合物。 利用DNA库可以帮助科学家研究DNA相关的疾病、药物发现和药物开发。通过筛选和评估该库中的化合物,科学家可以寻找新的DNA靶点抑制剂、DNA修复调节剂和其他与DNA相关的药物候选物,从而为治疗DNA相关疾病提供新的治疗策略和药物选项。 https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/dna-library
该库设计主要采用基于结构的方法。对于已知的与抑制剂共结晶的晶体结构,设计方案包括结构对齐和共同药效团识别、蛋白位点映射和约束分配、对接等步骤。对于未结合配体的蛋白质结构,使用PocketFinder和随后的InducedFit技术进行了潜在结合位点和关键残基的鉴定,该技术假定了柔性的位点环境。
我们的库包含了针对维持DNA稳定性的关键基础蛋白质的体外预测活性化合物。所有的目标都是基于它们的治疗影响进行分析,并分为以下几类: