ChemDiv 独特的PPI库包含12,103种化合物。
独特的PPI(蛋白质-蛋白质相互作用)库代表了一组前沿的小分子化合物集合,专门设计用于靶向和调节蛋白质-蛋白质相互作用,这是药物发现中的一个新兴领域。蛋白质-蛋白质相互作用对众多生物过程和通路至关重要,使其成为治疗干预的有吸引力的目标。然而,它们通常大而平的相互作用表面给小分子药物设计带来了独特的挑战。独特的PPI库直面这些挑战,采用创新的化学和分子框架,创造出能够有效结合并调节这些复杂界面的分子。该库精心挑选了具有多样化结构特征的化合物,提高了识别强效和选择性PPI抑制剂或稳定剂的可能性。
在PPI库中,每个化合物都基于其与PPI中关键热点和变构位点相互作用的潜力,通过结构生物学洞察和先进的计算建模技术精心挑选。该库涵盖了一系列分子,从针对癌症、神经退行性疾病和炎症等已明确表征的相互作用,到针对先前难以成药的靶点的开创性努力。通过专注于蛋白质-蛋白质相互作用的调节,该库为开发具有新作用机制的治疗药物开辟了新途径。此外,PPI库不断进化,持续的研究和筛选工作旨在扩大其多样性并增强其化合物的药理学特性,确保其始终处于药物发现创新的前沿。
分子的生物活性与其三维(3D)结构密不可分,这凸显了空间排列在其功能中的关键作用。在考虑PPI库的多样性时,分子形状多样性是其整体功能广度的主要指标。虽然“多样性”看似是一个主观概念,但文献一致强调了结构多样性的六个主要组成部分,这些对于增强库在药物发现中的潜力至关重要:
骨架多样性:指库中包含多种不同的分子框架,提供多种核心结构以与生物靶标相互作用。
官能团多样性:涵盖化合物中存在的多种官能团,这些官能团可显著影响分子的反应性和相互作用能力。
附加基团多样性(取代基或构建块多样性):这一方面捕捉了附着在共同骨架上的结构元素的变化,丰富了库中的侧链和修饰多样性。
立体化学多样性:原子空间排列的变化,特别是那些可能与大分子相互作用的原子,增加了多样性的关键层次,影响结合亲和力和特异性。
构象多样性:涉及包含能够采用多种构象的分子,从而增加找到与靶标相互作用最佳构象的机会。
链多样性:存在各种不同的链,特别是在骨架未唯一定义分子时,进一步多样化相互作用的可能性。