RNA靶向库EN
RNA靶向的药物发现在过去十年中发生了巨大变化，并已成为开发新一代药物的前沿。这一新阶段的RNA研究也称为“RNAissance”，归功于基因工程和基因组测序的最新进展。这让我们对研究针对难治和无法治愈的疾病的有效药物以及新的抗菌剂和抗病毒剂寄予厚望。 RNA是一种多功能生物分子，能够传递信息、采用独特的三维形状并对环境条件作出反应。这些生物结构可以发挥多种功能，从将遗传信息转化为细胞的分子机器和结构，到调节发育、细胞分化、环境变化等过程中基因的活动。 我们专注于研究小分子与RNA二级结构、tRNA和mRNA的3D折叠（避免直接靶向RNA螺旋和插入）的三种主要相互作用类型，并对 G-四链体和核糖开关的可用结构进行虚拟筛选。 使用RNA靶向库，您将获得多种好处，从而节省命中探索和优化的时间和成本： 命中确认支持：类似物搜索和命中样品从严格质量控制的干货中补给 通过并行化学直接且经济地合成命中后续库 通过现场广泛的 ADME/T 面板增强药物化学支持 https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/rna
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陶术生物化合物库目录(60.2 MB) 
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SDF G-四链体是基因组中由重复的鸟嘌呤束形成的高阶四链结构。尽管 DNA G-四链体比 RNA 更普遍，但 RNA 四链体在各种生物过程中仍然至关重要，例如表观遗传调控、端粒维持、线粒体 RNA 表达等。我们分析了所有已报道的 RNA G-四链体 (G4s) 结构，并基于 RNA 适体和 h-MYC G4s 建模创建了 6 个对接模型。
核糖开关是 mRNA 的细菌调节片段，由代谢物结合适体和表达平台组成。它们对于不同的过程至关重要：病毒基因的表达、基因调节功能、mRNA 编码的蛋白质的产生控制、催化反应、与其他 RNA 或调节大分子结合等等。鉴于哺乳动物细胞中不存在核糖开关，它们成为发现新抗菌药物的非常有吸引力的靶标。已经创建了 20 多个对接模型，用于以下核糖开关的计算机筛选：2-脱氧鸟苷、c-di-AMP、c-di-GMP、I 类 PreQ1、FMN、具有 G40A 突变的 glmS 核酶、谷氨酰胺 II、甘氨酸、鸟嘌呤、L-谷氨酰胺、赖氨酸、metY SAM V、preQ1 II 类、PreQ1、PRPP、s-腺苷同型半胱氨酸、SMK 盒 (SAM-III)、THF、thi-Box、thi-M、ZTP 核糖开关。
RNA 剪接调控可能是真核药物发现中最有吸引力的。调节 RNA 剪接将是治疗癌症和遗传疾病最有效的方法之一。我们专注于靶向调节和前体 mRNA 和激酶，这些活性是 RNA 剪接所必需的：富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子蛋白激酶 SRPK 和 CDC2 样激酶 CLK。
基于结构的方法（分子对接）已被用作文库构建的主要技术。分析了 RNA G4、核糖开关、mRNA 和 SRPK 和 CLK 激酶的所有可用 PDB 结构。选择了独特的“蛋白质-配体”复合物进行进一步分析和对接模型构建。G4 使用以下 PDB 结构：6C63、6e81、6E81、6E8S、7oa3、8EYV；和核糖开关：2hom、2miy、3b4b、3d0u、3e5e、3irw、3npn、3p49、3q50、3ski、4lvy、4nya、4nyb、4nyd、4qk8、4rzd、5c45、5ddq、6ck4、6fz0、6p2h、6qn3、6uc8、6uc9、6wzs。
