KINACore化合物库是一个通过计算筛选获得的、包含20,000余种类先导及类药小分子的化合物库。该库涵盖420多种新型骨架结构。KINACore库中的化合物筛选基于两种策略:一是与已发表激酶活性分子生成的3D药效团指纹相似性匹配,二是与从ATP腺苷部分生成的药效团特征相匹配。
亮点
• 基于新颖骨架的类先导化合物与类药化合物
• 对多种激酶具有潜在活性
方法
对于基于已发表活性化合物的KINACore库:从公共科学数据库中提取对激酶靶点具有活性的化合物,并基于其低能量三维构象生成三维药效团指纹。随后将这些指纹与ChemBridge公司设计的新颖骨架虚拟化合物所生成的三维药效团指纹进行比对。与已发表活性指纹高度相似的虚拟化合物将被合成,并纳入KINACore库的筛选范围。
对于基于ATP腺苷部分的KINACore化合物:这些化合物的筛选方法与从EXPRESS-Pick收藏库中遴选KINASet库化合物的流程完全一致。
潜在靶点
特性
KINACore库中的化合物具有类先导化合物和类药特性,其理化性质及计算参数的平均值与范围如下:
• 分子量:平均值 = 353;范围 = 240至500
• 脂肪族碳原子比例(Fsp3):平均值 = 0.53;范围 = 0.1至0.9
• 氢键供体数:平均值 = 1;范围 = 0至3
• 氢键受体数:平均值 = 4;范围 = 1至7
• 脂水分配系数(clogP):平均值 = 1.6;范围 = -1.8至5.4
• 拓扑极性表面积(TPSA):平均值=59;范围=20至110