犬尿氨酸通路化合物库
Kynurenine Pathway Library（犬尿氨酸代谢通路库）包含13120种化合物。旨在发现新的调节剂，用于代谢性疾病的发现。Kynurenine pathway（犬尿氨酸代谢通路）是一个代谢通路，通过降解色氨酸产生烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+）。该通路的紊乱与多种疾病和障碍相关，包括传染性疾病（例如HIV）、神经系统疾病（阿尔茨海默病（AD）、亨廷顿病（HD）和肌萎缩性脊髓侧索硬化症）、情感障碍（精神分裂症、抑郁症和焦虑症）、自身免疫疾病、周围病症和恶性肿瘤。我们的工作旨在寻找作用于酪氨酸代谢通路的新的潜在活性化合物，这些化合物可以作为早期药物开发的便捷且具有质量保证的起点。 https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/immuno-oncology-library/kynurenine-pathway-library
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陶术生物化合物库目录(60.2 MB) 
库化合物信息
Excel 
SDF 库设计
针对以下目标，使用所有可用的蛋白质和配体结构数据进行了潜在活性物质的搜索：吲哚胺二氧化酶（IDO）、色氨酸二氧化酶（TDO）、3-羟基蒽醌酸二氧化酶（3-HAO）、犬尿氨酸氨基转移酶（KATs）和犬尿氨酸3-单加氧酶（KMO）。
筛选模型的制备和验证
从PDB检索了所有可用的目标的3D结构。通过结构的交替对齐和比较，发现每个单独的蛋白质目标的序列相似性都高于90％，RMSD在0.4 - 0.71 Ų的范围内。考虑到所有代表性结构，仅选择一个用于模型的制备，同时考虑到配体结合参数（蛋白质-天然配体）和结合位点的几何参数。
分子对接和药效团搜索
基于已知活性化合物和“蛋白质-天然配体”复合物，构建和验证了基于配体的（IDO：3个，TDO：4个，KATs：3个，KMO：2个）和基于结构的（IDO：3个，TDO：6个，3-HAO：2个，KATs：3个，KMO：4个）药效团模型。然后对包含超过1百万个化合物的药物样库（Enamine数据库）进行了筛选。
总体而言，这种方法旨在识别潜在的对于犬尿氨酸途径具有活性的化合物，并为代谢紊乱领域的药物开发提供起点。
