抗病毒化合物库LF
由于病毒引起的疾病种类繁多，通过抗病毒药物和疫苗应对病毒性疾病仍然是一个持续的挑战。特别令人关切的是缺乏普遍的治疗方法。抗病毒药物发现的最初障碍是病毒血清型的多样性，这使得我们解决这个问题的努力更加复杂。治疗失败通常是由于病毒突变产生的耐药性而发生的。此外，大多数病毒代谢过程与宿主细胞的代谢过程重叠，导致开发选择性抗病毒药物的复杂性增加。幸运的是，某些病毒酶和多功能病毒蛋白（如衣壳蛋白）不存在于人体细胞中，这使我们能够将它们用作抗病毒药物开发的有吸引力的靶点。
2022 年，世界卫生组织强调对新型抗病毒医疗产品的迫切需求，报告称全球有超过 630,000 人死于 HIV 相关疾病 。截至 2019 年的数据，慢性丙型肝炎感染每年导致约 400,000 人死亡。乙型肝炎也在 2019 年造成约 820,000 人死亡，主要由肝硬化和肝细胞癌引起。此外，在 2019 年，世界面临着由 SARS-CoV-2 引起的大流行，全球 COVID-19 死亡人数超过 600 万。这些统计数据使得能够对抗病毒基因组不断变化的性质的强效抗病毒药物的发展成为了最重要的。
Lifechemical的化学信息学团队在药物化学最紧迫的领域进行研究，创建了一个专门的抗病毒库集合，专为高通量筛选 （HTS） 和高内涵筛选 （HCS） 药物发现项目而设计。总的来说，这些筛选库包括 20,000 多种具有潜在抗病毒活性的类药物筛选化合物：
1.2D相似性抗病毒文库（1 5,4 00种化合物）
2.基于配体和基于结构的组合方法的抗病毒库（3,500 种化合物）
3.抗病毒靶向文库（1,300 种化合物）
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陶术生物化合物库目录(60.2 MB) 
库化合物信息
Excel 
SDF 通过2D相似性筛选的抗病毒化合物库
这一抗病毒筛选化合物库是通过对参考集合中46,518个生物活性化合物（IC50、Ki等小于10 μM，抑制率> 25%）进行2D指纹相似性搜索设计的。这些化合物来自于不同病毒物种及其感兴趣的蛋白质的治疗相关病毒测定（从Binding、ChEBI、PubChem和ChEMBL数据库提取）。
随后，使用Tanimoto 80%相似性截断值在MDL公共键指纹上筛选了Life Chemicals HTS化合物集合中具有已知抗不同病毒物种和病毒靶点活性的分子的类似物。总共挑选出了超过15,400种独特的结构多样化化合物用于这一筛选集。
结合配基基础和结构基础方法的抗病毒化合物库
为了识别蛋白质-配体结合机制的关键特征，首先从RCSB Protein Data Bank收集了最有趣和广泛分布的抗病毒分子靶标的相关蛋白质晶体结构。然后从ChEMBLdb（v26）提取了抗病毒分子的参考集合。针对每个靶标具有最高报道抗病毒活性（IC50小于1-1.5 uM）的化合物进行了聚类。从每个组中挑选出的顶级化合物被对接到相应靶标的晶体结构中，以获得生物活性构象。对于没有解析结构的靶标，利用生成构象的刚性对齐和统计分析预测了抑制剂的生物活性构象。这些对齐结构进一步用于体外药效团建模。采用Glide对接和UNITY药效团搜索方法选择了最有前景的与抗病毒相关的化合物。
结合配基基础和结构基础方法用于设计这一抗病毒化合物库，提供了方法交叉验证和更高的准确度。结果，在Life Chemicals HTS化合物集合中鉴定出了超过3,500种潜在的抗病毒药物。所有PAINs和活性化合物均通过内部药物化学过滤器在选择过程中被排除。
