Matrix metalloproteinase-2（MMP2，凝胶酶A，72 kDa型IV胶原酶）参与多种功能，如血管重建、血管生成、组织修复、炎症、肿瘤侵袭和动脉粥样硬化斑块破裂。MMP2基因突变与Torg-Winchester综合征、关节病综合征、多中心骨溶解和其他病理相关。因此，靶向凝胶酶-2的小分子化合物可能是治疗与MMP2异常功能相关的多种疾病的潜在方法。为了库的设计，基于已知的MMP2抑制剂开发了12个训练集。这些化合物根据分子指纹进行聚类和分类，使用基于k-NN的方法将其划分为活性或非活性化合物，以实现更均匀的训练集。这些训练集用于贝叶斯建模（基于分子描述符，如氢键供体和受体数量，PSA，LogP，分子量，可旋转键数，环数和指纹ECFP4、FCFP4、ECFP6和FCFP6），以及使用k-NN算法选择化合物（基于指纹ECFP4、FCFP4、ECFP6和FCFP6）。贝叶斯统计和k-NN方法的组合可增加在筛选过程中发现的活性化合物数量。从这些方法的应用中获得的得分最高的化合物进行交叉验证和可视化分析。设计的MMP2靶向库仅包含药物样化合物（排除PAINS化合物），其中包含螯合剂基团。它为与基质金属蛋白酶-2相关的药物发现项目提供了良好的基础。