p38 MAP激酶家族共有四个成员。它们在组织分布、激酶激活调节以及对下游底物的磷酸化方面存在差异。它们还在对p38 MAP激酶抑制剂的敏感性方面存在差异。最为研究广泛的亚型是p38 alpha,其在许多造血和非造血细胞类型中在适当的刺激下被观察到活化。
吡啶基咪唑化合物,以SB 203580为例,最初是作为炎症细胞因子合成抑制剂制备的,后来发现它是p38 MAP激酶的选择性抑制剂。SB 203580通过在ATP口袋中的竞争性结合来抑制p38 MAP激酶的催化活性。目标酶与抑制剂复合物的X射线晶体学研究支持了定点诱变研究的观察结果,从而为理解这些抑制剂的激酶选择性提供了分子基础。
p38 MAP激酶抑制剂在多种疾病模型中均显示出疗效,包括炎症性关节炎及其他关节疾病,以及脓毒性休克和心肌损伤。在所有情况下,关键细胞类型中的p38激活与疾病的起始和进展相关。使用p38 MAP激酶抑制剂治疗可减轻p38激活和疾病严重程度。结构多样的p38 MAP激酶抑制剂已在临床前研究中得到广泛测试。
Life Chemicals的MAP Focused Library旨在寻找能够结合到蛋白质的ATP结合位点并与激活环内DFG-in构象的I型抑制剂。其中包括超过1,100个潜在的p38丝裂原活化蛋白(MAP)激酶抑制剂。
p38 MAP激酶抑制剂在多种疾病模型中表现出良好的疗效,包括炎症性关节炎、其他关节疾病、败血症休克和心肌损伤等。在所有情况下,p38的活化与疾病的发生和发展密切相关。使用p38 MAP激酶在3BV2 PDB记录中的结构进行了分子对接研究。分子对接使用DOCK4.0-6.0程序进行,并对结果进行了分析。分子动力学(MD)模拟和蛋白质结构的准备使用GROMACS软件进行。配体分子经过GAMESS和GROMACS的处理。对接过程的主要特征和限制来自蛋白质结合口袋中以下关键残基:Met109,Glu110,Asp168,Glu71,Lys53 -供体/受体位点;Thr106,Phe169,Leu74,Leu75,Val30,Leu171,Leu108 -负责疏水相互作用。