选择临床前和临床试验中的分子 (23 个结构) 和早期发育阶段 (7 个结构)。根据文献资料 (IC50 = 5μM) 设定活性阈值。将数据集合并，去除重复数据，最终的活性分子数据库由 22 个结构组成。每个结构的构象被生成，彼此叠加，并且药效团假设被发展基于这些数据。
ChemDiv 验证的化学空间与活性分子数据库 (22) 重叠。因此，选择了具有高二维相似性和二维拓扑值的结构 (30137)。对所选结构分别生成三维构象。
结果，从 ChemDiv 化学空间中选出了 2751 个满足药效团假说的结构。