基于受体方法的 PPI 靶向化合物库
蛋白质之间直接相互作用的复杂网络——即相互作用组——对生物系统和疾病发展的重要性已被广泛认可。尽管如此，与其他药物类别相比，通过直接破坏两个蛋白质之间相互作用的小分子药物相对较少，蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）被视为具有挑战性，在某些情况下甚至被认为是“不可成药”的靶点。然而，最近的研究报告表明，某些类别的PPI可以通过小分子抑制来实现。通常，这些PPI抑制剂通过结合到球状蛋白表面的口袋中，破坏球状蛋白与伴侣蛋白上单个肽链之间的相互作用。PPI可以根据球状蛋白和肽链中共同的结构元素进行分类。最值得注意的是，肽链中二级结构特征（如α螺旋和β链）的存在，对于通过模拟和取代这些肽链来设计抑制剂具有重要影响。
Life Chemicals 通过基于受体的方法设计了PPI筛选库，该方法汇集了多个最具吸引力的PPI靶点，通过破坏蛋白质之间的特定功能相互作用来进行治疗干预。这些靶点包括溴结构域、整合素、凋亡调节因子和癌蛋白，它们属于不同的PPI类型，并已被证明可通过小分子化合物进行药物化。
此处展示的是一组潜在的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）调节剂化合物库，包含超过9,300种结构多样的筛选化合物。
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陶术生物化合物库目录(60.2 MB) 
库化合物信息
Excel 
SDF 设计该化合物库的方法基于将Life Chemicals高通量筛选化合物库灵活分子对接至每个药物靶点的PPI界面，以预测具有最高亲和力的分子，从而具备阻止与结合伙伴相互作用的能力。在合理范围内，允许使用多种对接约束（位置、氢键、金属螯合）以及参与蛋白质-配体相互作用的氨基酸可旋转基团。
为了涵盖包括拟肽分子在内的相关化学空间，该库并未遵循Lipinski's五规则。每个筛选子集均包含无PAINS、无毒性和无反应基团的类药筛选化合物，这些化合物是潜在的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）结合物。以下PPI相关分子靶标为筛选目标：
Keap1
BCL‑2
MDM2–p53
LFA1–ICAM1
αIIbβ3
IAP
BET溴结构域
BRD9
