RNA相关蛋白筛选库

RNA-associated Protein Screening Library

产品编号: LF1140

众所周知，RNA结合蛋白（RBPs）在多种细胞过程中扮演着关键角色，包括基因表达和RNA代谢。它们与肿瘤发生相关的失调使其成为癌症药物发现中的有前景的靶点。因此，针对RNA相关蛋白的小分子靶向治疗为影响细胞过程的疾病提供了高度选择性治疗的良机。
基于此，Life Chemicals公司开发了包含超过6500种类药小分子化合物的RNA相关蛋白筛选库，为转录后基因调控和抗癌药物开发相关领域的药物发现研究提供了一个有前景的起点。

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产品编号: LF1140

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产品描述

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背景
尽管RNA靶向化合物作为潜在治疗药物持续受到关注，蛋白质仍是临床批准小分子药物的主要靶点。结构生物学的进步为新药开发提供了RNA-蛋白质相互作用机制的深入理解，从而推动了针对RNA相关蛋白质的新药研发。
长期以来，RNA相关蛋白因其通常非催化性且与RNA的相互作用复杂，难以设计特异性抑制剂，被视为“不可成药”。然而，最近已发现多种小分子抑制剂针对不同的RNA相关蛋白靶点。特别是，这一策略已被用于靶向致癌性miRNA和HIV，并预测这些抑制剂可作为抗真菌剂有效。因此，通过调节RNA相关蛋白的活性，有可能治疗从癌症到病毒感染的多种疾病。
库设计
首先，从文献来源中收集了一组被报道为能够与RNA结合蛋白结合的分子参考集，使用了PDB和ChEMBL数据库。随后，通过剔除具有低解离常数（Kd > 10 μM；抑制，IC50等 ≤ 10μM）的化合物，对结合活性进行了限制。
接下来，对Life Chemicals高通量化合物库进行了二维相似性搜索，保持了较高的多样性值（Tanimoto和Tversky指数分别≥0.80和≥0.85）。结果，筛选出了超过6,500种具有预测RNA相关蛋白结合活性的类药化合物，构成了最终的筛选集。

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