我们认为，未来RNA导向药物发现的一个关键组成部分是获得包含小分子的适当筛选集合，以有利的方式增加与靶点接触的可能性。这种库的选择可以基于结合腔的结构知识、与RNA互补的物理化学性质以及其他药理学性质，如细胞渗透性。为了了解潜在的可药用RNA靶向的范围和适用的筛选库，我们分析了PDB数据库中的RNA结构，提取了30种最有前景的大分子配体复合物。基于这30种RNA结构，我们创建了16个药效团查询，这些查询捕捉了与RNA结合的小分子配体的特征。然后，我们将生成的查询应用于ASINEX BioDesign和Elite集合的搜索。这些搜索结果产生了数百个可以用特定药效团标记的分子。