SH2结构域靶向化合物库是通过药效团建模方法设计的。总体方案如下：

对每个组中的SH2结构域进行了结构叠加。生成了可能与这些结构的结合表面相互作用的所有药效团特征。在聚类后选择了正确的特征。因此，得到了一组药效团模型（每个组从2到12个）。这些模型经过验证、优化，并选择了最佳模型。SH2结构域中有两个主要的含磷酸酪氨酸肽结合区域：磷酸酪氨酸结合区域和特异性识别区域。在药效团筛选过程中，选择了与这两个区域相互作用的得分最高的化合物。在最后阶段，选择的化合物进行了聚类，以增加SH2结构域靶向化合物库的多样性。