转录因子是基因表达和转录的核心调控因子,对细胞发育、分化和死亡起着关键作用。许多疾病,如神经退行性疾病、糖尿病和癌症,都与转录网络的失调有关。除了配体激活的核受体外,小分子化合物直接调节转录因子功能仍被广泛认为“不可能”。药物靶向方法主要针对与必需辅助因子、转录因子二聚体伴侣、伴侣蛋白或调节亚细胞穿梭的蛋白质的蛋白质-蛋白质界面,只有少数研究致力于直接干扰DNA结合的化合物。替代策略包括DNA嵌入、烷基化或DNA沟槽结合化合物,这些化合物要么阻断转录因子结合,要么改变共识DNA链的三维构象。
近来,针对小分子靶向转录因子的研究进展、与这些蛋白质复杂功能和调控相关的挑战,以及转录因子药物靶向的未来方向和应用,引起了广泛关注。已发现多种小分子在细胞培养中,甚至在某些情况下在体内,能够抑制转录因子(包括STAT家族、NF-κB和Myc)的活性。
为支持与转录相关的药物发现,Life Chemicals专门设计了一套包含超过9,200种转录相关筛选化合物的库,用于高通量筛选。
首先,从ChEMBL数据库中获取了一组已知的转录相关蛋白调节剂参考集(包含超过46,990个预筛选化合物,涉及120,000多个活性条目)。接着,以Tanimoto指数≥0.8为条件,对Life Chemicals专有的高通量筛选化合物库进行了二维指纹相似性搜索(每个参考化合物最多限10个类似物),最终获得了近23,700个转录相关分子(该扩展化合物集可根据需求提供)。随后,根据报告的活性值(<10 μM)进行过滤,并应用内部药物化学过滤器(排除PAINS、有毒和反应性化合物),最终得到了超过9,200个类药筛选化合物的最终集合。